スペースの「関連リンク」の並び順を変更することはできません。
「関連リンク」にアプリやスペースを追加した場合は、上から順に次のとおり並びます。

1.アプリの作成日時の降順
2.スペースの更新日時の降順

参考となりますが、スペースやスレッドの本文にアプリのリンクを任意の順番で記載したり、関連するアプリを貼り付けたりすることは可能です。
これらの方法で、関連するアプリやスペースの情報をまとめる運用も、よろしければご検討ください。