「表示できないユーザー」は、ユーザー名の代替表記です。
組織間のアクセスを禁止にしている場合に、アクセスできない組織に所属しているユーザー名が「表示できないユーザー」として表示されます。
組織間のアクセス権とは

具体的な表示条件は、下記の現象1と現象2を確認してください。

組織間のアクセスが禁止されていると、所属組織が異なるユーザー間で、互いのプロフィールや組織情報を閲覧できません。
このため、「グループ会社-A」のメンバーが投稿したコメントを、「グループ会社-B」のメンバーが閲覧すると、「グループ会社-A」のメンバーの名前が「表示できないユーザー」として表示されます。

cybozu.comでは、ユーザー情報が削除されると、そのユーザーの所属組織の情報も削除されます。
「グループ会社-A」にいたユーザーであっても、ユーザー情報が削除されたあとは、組織に未所属のユーザーとして扱われます。
このため、「グループ会社-A」のメンバーが、削除されたユーザーYのコメントを確認すると、ユーザーYが「表示できないユーザー」として表示されます。

解決したい現象によって対応が異なります。

組織間のアクセス権を解除します。

ユーザーを削除せずに、使用状態を「停止中」に変更します。
ユーザーを使用停止にする